Pengorbit JUICE akan melakukan penyiasatan terperinci mengenai Ganymede dan menilai potensinya untuk menyokong kehidupan. Siasatan ke atas Europa dan Callisto akan melengkapkan gambaran perbandingan bulan-bulan Galileo ini.[19] Tiga bulan dianggap menampung lautan air cecair dalaman, dan begitu juga penting untuk memahami kebolehdiaman dunia berais.

Objektif sains utama untuk Ganymede, dan sedikit sebanyak untuk Callisto, adalah:[19]

• Pencirian lapisan lautan dan pengesanan takungan air bawah permukaan yang diduga
• Pemetaan topografi, geologi dan komposisi permukaan
• Kajian sifat fizikal kerak berais
• Pencirian taburan jisim dalaman, dinamik dan evolusi bahagian dalaman
• Penyiasatan atmosfera ringkas Ganymede
• Kajian tentang medan magnet intrinsik Ganymede dan interaksinya dengan magnetosfera Musytari.

Bagi Europa, tumpuan diberikan kepada kimia yang penting kepada kehidupan, termasuk molekul organik, dan pemahaman pembentukan ciri permukaan dan komposisi bahan bukan air-ais. Tambahan pula, JUICE akan memberikan bunyi pertama di bawah permukaan bulan, termasuk penentuan pertama ketebalan minimum kerak berais di kawasan yang paling aktif baru-baru ini.

Pemerhatian spatial yang lebih jauh juga akan dijalankan bagi beberapa satelit kecil yang tidak teratur serta bulan Io yang aktif gunung berapinya.